Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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