Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms