Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Bud23Q9CY21 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms