Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc17Q9CXD9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc17Q9CXD9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc17Q9CXD9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc17Q9CXD9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc17Q9CXD9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Lrrc17Q9CXD9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Lrrc17Q9CXD9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Lrrc17Q9CXD9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc17Q9CXD9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Lrrc17Q9CXD9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc17Q9CXD9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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