Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms