Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CWU4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms