Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms