Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms