Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ykt6Q9CQW1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms