Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms