Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms