Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms