Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd5Q9CQP3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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