Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms