Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQ90 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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