Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms