Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
1700129C05RikQ9CQ77 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
1700129C05RikQ9CQ77 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700129C05RikQ9CQ77 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700129C05RikQ9CQ77 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700129C05RikQ9CQ77 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700129C05RikQ9CQ77 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700129C05RikQ9CQ77 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700129C05RikQ9CQ77 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms