Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms