Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pkp2Q9CQ73 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms