Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms