Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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