Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efcab2Q9CQ46 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcab2Q9CQ46 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms