Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT5

Nop16, Nucleolar protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop16Q9CPT5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop16Q9CPT5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop16Q9CPT5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms