Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm22Q9CPQ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tomm22Q9CPQ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms