Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms