Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl4dQ99PE9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms