Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nup155Q99P88 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms