Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rassf3Q99P51 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms