Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims1Q99NE5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms