Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms