Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf17Q99MV7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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