Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbc3Q99ML1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms