Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms