Protein–RNA interactions for Protein: Q99K99

Uncharacterized protein C4orf19 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99K99 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99K99 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99K99 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99K99 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99K99 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99K99 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99K99 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99K99 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99K99 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99K99 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99K99 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99K99 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms