Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ctu1Q99J10 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ctu1Q99J10 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ctu1Q99J10 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctu1Q99J10 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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