Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sntg2Q925E0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sntg2Q925E0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms