Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms