Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms