Protein–RNA interactions for Protein: Q91XS1

Mtmr4, Myotubularin-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr4Q91XS1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mtmr4Q91XS1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mtmr4Q91XS1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms