Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms