Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klc3Q91W40 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms