Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms