Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms