Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8VDP2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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