Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS6

Med9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med9Q8VCS6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med9Q8VCS6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms