Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms