Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms