Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28aQ8K3Y3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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