Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot6Q8K3P5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms