Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vrk3Q8K3G5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vrk3Q8K3G5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vrk3Q8K3G5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vrk3Q8K3G5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vrk3Q8K3G5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vrk3Q8K3G5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vrk3Q8K3G5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vrk3Q8K3G5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vrk3Q8K3G5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vrk3Q8K3G5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vrk3Q8K3G5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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